أنشئت إدارة الجودة والإعتماد الأكاديمي بالقرار رقم 1/2/1389 وتاريخ 21/12/1428هـ، وهي إدارة مستقلة ترتبط برئيس الجامعة مباشرة، وتعمل على ضمان الجودة في الكليات والمراكز والإدارات المساندة لتحقيق رسالة الجامعة وأهدافها.